2016年3月30日，昆明南大脑科医院与昆明医科大学第二附属医院签订合作协议，在双向转诊、医疗服务、科学建设、人才培养、科学研究等方面开展全面合作，正式成为昆明医科大学第二附属医院临床协作单位。

昆明医科大学第二附属医院建于1952年，原名“昆明市工人医院”，现已发展成一所科室齐全、名医荟萃、设备精良、技术力量雄厚的集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的大型综合性三级甲等医院，是“全国百佳医院”及紧急救援中心(SOS)网络医院，是人力资源和社会保障部、全国博士后管理委员会批准认定的博士后科研工作站。建院以来，昆明医科大学第二附属医院一直尊崇“明德至善”的院训，倡导家园意识和“关爱生命，情系患者，诚信友爱，和谐发展”的价值观，始终坚持“以病人为中心，以提高医疗、教学、科研质量为根本，与人民健康同行”的宗旨，为增进人民健康，促进云南社会经济发展，维护边疆和谐稳定做出了突出贡献。

昆明南大脑科医院坐落在昆明市风景秀丽的西山脚下，与眠山森林生态公园比邻，由我国神经外科泰斗冯忠堂教授担任名誉院长，国内知名神经内科专家雷勋杰主任担任院长，医院技术力量雄厚，是一所以脑病临床诊疗为特色，集医疗、康复、科研为一体的现代化大型脑病专科医院，是昆明市医保定点医院。

医院下设20个临床诊疗和功能检查科室，其中神经内科、功能神经外科、精神心理科、神经康复科、神经内科癫病诊疗中心为院内重点科室。拥有西南地区居领先水平的极具专业特色优势的癫病诊疗中心、小儿脑瘫诊疗中心、帕金森病诊疗中心、三叉神经痛诊疗中心、精神病诊疗中心、神经康复中心及ICU(重症加强护理病房)。强大的功能神经外科能开展脑立体定向技术脑立体定向手术，治疗帕金森病、癫病、脑瘫、精神类疾病、肌张力障碍、痉挛性斜颈、特发性震颤、、脑出血、脑肿瘤等疾病，以其微创、准确、安全、有效等优势，在云、贵、川地区具有重要的影响力和知名度。

医院汇集了国内知名的神经内、外科专家，并与北京、广州等一线城市的多家三甲医院建立联系，形成医疗资源和诊疗技术共享，打造一流专家平台，与数十名专家、教授形成长期合作关系。

现昆明南大脑科医院与大型综合性三级甲医院昆明医科大学第二附属医院(昆明市工人医院)建立医联体合作，为更多的患者摆脱疾病困扰。